Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRAPPC8Q9Y2L5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms