Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK3Q9Y2K2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIK3Q9Y2K2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIK3Q9Y2K2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms