Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFSF13BQ9Y275 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFSF13BQ9Y275 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms