Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GINS2Q9Y248 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GINS2Q9Y248 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GINS2Q9Y248 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GINS2Q9Y248 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GINS2Q9Y248 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GINS2Q9Y248 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GINS2Q9Y248 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GINS2Q9Y248 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GINS2Q9Y248 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GINS2Q9Y248 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GINS2Q9Y248 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GINS2Q9Y248 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GINS2Q9Y248 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GINS2Q9Y248 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GINS2Q9Y248 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GINS2Q9Y248 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GINS2Q9Y248 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GINS2Q9Y248 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GINS2Q9Y248 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GINS2Q9Y248 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms