Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POMPQ9Y244 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMPQ9Y244 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms