Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIGD1AQ9Y241 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms