Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCML2Q9UQR0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms