Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRFN2Q9ULH4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms