Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RARRES3Q9UL19 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms