Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSPAN16Q9UKR8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN16Q9UKR8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms