Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
RCAN3Q9UKA8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RCAN3Q9UKA8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RCAN3Q9UKA8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms