Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGEF1Q9UJ41 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
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