Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPN3Q9UHW5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPN3Q9UHW5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms