Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGXB4Q9UGU5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGXB4Q9UGU5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGXB4Q9UGU5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.2 ms