Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNOT8Q9UFF9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms