Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REV1Q9UBZ9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.32■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REV1Q9UBZ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
REV1Q9UBZ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REV1Q9UBZ9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REV1Q9UBZ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REV1Q9UBZ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REV1Q9UBZ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REV1Q9UBZ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REV1Q9UBZ9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REV1Q9UBZ9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
REV1Q9UBZ9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REV1Q9UBZ9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REV1Q9UBZ9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REV1Q9UBZ9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REV1Q9UBZ9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REV1Q9UBZ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REV1Q9UBZ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REV1Q9UBZ9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REV1Q9UBZ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REV1Q9UBZ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms