Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEF1Q9UBV8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEF1Q9UBV8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEF1Q9UBV8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEF1Q9UBV8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PEF1Q9UBV8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEF1Q9UBV8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEF1Q9UBV8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEF1Q9UBV8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms