Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXTL2Q9UBQ6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 568.6 ms