Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SENP1Q9P0U3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms