Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC59Q9P031 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms