Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSRB1Q9NZV6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSRB1Q9NZV6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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