Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMCD1Q9NZU5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LMCD1Q9NZU5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMCD1Q9NZU5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms