Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD2Q9NZR1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms