Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMOD4Q9NZQ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD4Q9NZQ9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms