Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKIRAS1Q9NYS0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms