Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM53CQ9NYF3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms