Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTMR4Q9NYA4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTMR4Q9NYA4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTMR4Q9NYA4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTMR4Q9NYA4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTMR4Q9NYA4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTMR4Q9NYA4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
MTMR4Q9NYA4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTMR4Q9NYA4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms