Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BARHL2Q9NY43 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BARHL2Q9NY43 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms