Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAK1IP1Q9NWT1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms