Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SLC52A1Q9NWF4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLC52A1Q9NWF4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SLC52A1Q9NWF4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms