Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIC8BQ9NVN3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RIC8BQ9NVN3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIC8BQ9NVN3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms