Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARVAQ9NVD7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARVAQ9NVD7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARVAQ9NVD7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARVAQ9NVD7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PARVAQ9NVD7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVAQ9NVD7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms