Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF3Q9NUQ8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms