Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms