Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC3Q9NUD5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms