Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SALL1Q9NSC2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SALL1Q9NSC2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SALL1Q9NSC2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SALL1Q9NSC2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms