Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SERINC1Q9NRX5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERINC1Q9NRX5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms