Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC52A3Q9NQ40 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms