Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASCL3Q9NQ33 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASCL3Q9NQ33 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms