Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDH12Q9NPG4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms