Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TREM1Q9NP99 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms