Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHS2Q9NP85 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NPHS2Q9NP85 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms