Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDFQ9HBH1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDFQ9HBH1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDFQ9HBH1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDFQ9HBH1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDFQ9HBH1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDFQ9HBH1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDFQ9HBH1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDFQ9HBH1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDFQ9HBH1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDFQ9HBH1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDFQ9HBH1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDFQ9HBH1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDFQ9HBH1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDFQ9HBH1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDFQ9HBH1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDFQ9HBH1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDFQ9HBH1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDFQ9HBH1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms