Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LY9Q9HBG7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LY9Q9HBG7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LY9Q9HBG7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LY9Q9HBG7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LY9Q9HBG7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LY9Q9HBG7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LY9Q9HBG7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LY9Q9HBG7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LY9Q9HBG7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LY9Q9HBG7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LY9Q9HBG7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LY9Q9HBG7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LY9Q9HBG7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LY9Q9HBG7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LY9Q9HBG7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms