Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ELP3Q9H9T3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ELP3Q9H9T3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms