Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf33Q9H7E9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf33Q9H7E9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf33Q9H7E9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf33Q9H7E9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf33Q9H7E9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms