Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TDRD3Q9H7E2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TDRD3Q9H7E2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms