Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C11orf49Q9H6J7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms