Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX17Q9H6I2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SOX17Q9H6I2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms