Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP2Q9H5N1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP2Q9H5N1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP2Q9H5N1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP2Q9H5N1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP2Q9H5N1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP2Q9H5N1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP2Q9H5N1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP2Q9H5N1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP2Q9H5N1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP2Q9H5N1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP2Q9H5N1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP2Q9H5N1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP2Q9H5N1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP2Q9H5N1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABEP2Q9H5N1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABEP2Q9H5N1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABEP2Q9H5N1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms